Обратившись к Тёмной стороне Силы и став учеником Дарта Сидиуса, Дуку начал выполнять коварный план учителя по уничтожению Ордена джедаев. Его первой жертвой вступительным взносом Сидиусу стал его старый друг, магистр Сайфо-Диас. Одной из первоочередных задач графа Дуку стал поиск человека, который послужил бы прототипом для армии клонов, заказанной от имени Сайфо-Диаса у каминоанцев. Для того, чтобы найти наиболее способного охотника за головами, Дуку назначил награду в пять миллионов кредитов за голову лидера секты Бандо Гора, своей бывшей ученицы Комари Восы.
Множество охотников за головами прельстилось наградой, но до Колмы, одной из лун Богдена, где скрывалась Воса, добраться удалось только Джанго Фетту и Монтроссу. Джанго Фетт убил Монтросса, отомстив таким образом за смерть своего приёмного отца, захватил Восу и привез её Дуку. После этого Дуку предложил ему стать образцом для клонирования, и Фетт согласился при условии, что частью награды станет один немодифицированный клон. После этого Дуку убил Комари Восу, таким образом, порвав все свои связи с Орденом джедаев.
В 24 году до явинской битвы, впервые после своего ухода из Ордена, Дуку появился на публике. На Раксусе Прайме он открыто обвинил Республику и Орден Джедаев в разложении, лицемерии, потворстве коррупции и прочих тяжких грехах. Он призвал правительства звёздных систем выйти из состава Республики и присоединиться к сепаратистскому движению, как вдруг
В три световых меча на грудь меня чуть прибило
Под выстрелами бластера сердце биться не хотело
Тело двигать не могло, по голове мечом
Размытая картина - но я дышу всем назло

Меня били силой об стены, так, чтоб я не мог встать
Какое там дышать! Я даже не мог простонать
Один сукин Квай-Гон вколол в мою ногу световой меч
Просто так ему ништяк увидеть мидихлорианы по колено

Я полз, как змея, рассматривая злые рыла
Зеленая одна скотина плюнуть на меня посмела
Сжимаясь в комок, теряя мысленный контроль,
Я вылетел из тела в силу, наблюдая за собой,

Запоминая интонацию, структуру, слова
Я из последних сил небесных вернулся в себя
И только громкий смех этих джедайских козлов
В памяти запечатлел
Начало войны клонОв

Три месяца спустя остыла голова - я вышел из больницы
На дворе была уже весна. Мой наставник мне помог
Найти адреса и изучив от начала и до конца, узнав их имена,
Я приступил к делу, хотя ещё болело тело

Но страшная месть ситхов мною овладела,
Во мне кипела, как в тот тёмный вечер
Когда меня четыре джедая хотели покалечить

Один любил гонки [Boonta Eve Classick:
Его случайно в гараже подом придавило
Второй сидел на сосредоточении и любви к жизни
Врачи поставили диагноз: переход в силу в теле
Третий впервые решил купить мандалорианскую броню:
Реактивный ранец заглох, как в злом анекдоте
Четвёртый понял в чём дело и на Дагоба удрал
Из галактики на долгие года без вести пропал.

Я в грудь не бил, мол я отомстил
Я просто напомнил: Дерись один на один
И никогда не ебашь молнией в разбитое лицо,
Даже если превосходство силы
Четыре против одного